Шестой сезон Клиники приносит значительные перемены в жизни персонажей. Джей Ди сталкивается с неожиданной новостью о беременности своей девушки, доктора Ким Бриггс, что заставляет его пересмотреть свои приоритеты и примерить на себя роль отца. Параллельно Тёрк и Карла становятся родителями дочери Иззи, а их отношения проходят испытания новыми родительскими обязанностями. Эллиот готовится к свадьбе с Китом, но её терзают сомнения из-за сохранившихся чувств к Джей Ди, что создаёт эмоциональное напряжение в их сложных взаимоотношениях.
Семейная жизнь Доктора Кокса и Джордан также претерпевает изменения с рождением ещё одного ребёнка, добавляя новые заботы к их и без того хаотичному существованию. Однако сезон омрачён трагическим событием — смертью медсестры Лаверн, что глубоко затрагивает весь коллектив больницы и становится моментом эмоциональной зрелости для многих персонажей. Эти личные драмы разворачиваются на фоне привычной рабочей рутины в клинике Святого Винсента, где профессиональные вызовы переплетаются с глубоко личными переживаниями героев.